Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GMFBP60983 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GMFBP60983 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GMFBP60983 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GMFBP60983 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GMFBP60983 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms