Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACTBP60709 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTBP60709 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTBP60709 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTBP60709 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTBP60709 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTBP60709 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTBP60709 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTBP60709 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACTBP60709 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTBP60709 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTBP60709 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms