Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB25P57735 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB25P57735 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB25P57735 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms