Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RIPPLY3P57055 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms