Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN15P56746 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms