Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NAPAP54920 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NAPAP54920 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NAPAP54920 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NAPAP54920 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NAPAP54920 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NAPAP54920 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NAPAP54920 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAPAP54920 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAPAP54920 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAPAP54920 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAPAP54920 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAPAP54920 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAPAP54920 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAPAP54920 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NAPAP54920 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms