Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCR4P51679 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCR4P51679 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCR4P51679 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCR4P51679 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCR4P51679 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCR4P51679 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCR4P51679 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCR4P51679 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms