Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DAP3P51398 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
DAP3P51398 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms