Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCT4P50991 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCT4P50991 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT4P50991 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT4P50991 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT4P50991 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT4P50991 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCT4P50991 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCT4P50991 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT4P50991 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT4P50991 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT4P50991 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT4P50991 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT4P50991 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT4P50991 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCT4P50991 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms