Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRE11P49959 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRE11P49959 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRE11P49959 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRE11P49959 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRE11P49959 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MRE11P49959 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRE11P49959 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRE11P49959 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRE11P49959 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRE11P49959 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRE11P49959 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRE11P49959 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRE11P49959 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRE11P49959 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRE11P49959 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRE11P49959 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRE11P49959 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRE11P49959 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRE11P49959 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRE11P49959 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MRE11P49959 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRE11P49959 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRE11P49959 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRE11P49959 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRE11P49959 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRE11P49959 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRE11P49959 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms