Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDK8P49336 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDK8P49336 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK8P49336 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK8P49336 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK8P49336 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK8P49336 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms