Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCR1P46094 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
XCR1P46094 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCR1P46094 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCR1P46094 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCR1P46094 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCR1P46094 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCR1P46094 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCR1P46094 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCR1P46094 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCR1P46094 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCR1P46094 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
XCR1P46094 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
XCR1P46094 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
XCR1P46094 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
XCR1P46094 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms