Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIA2P42262 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms