Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXD13P35453 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms