Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL9P32969 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL9P32969 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL9P32969 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL9P32969 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL9P32969 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL9P32969 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL9P32969 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RPL9P32969 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms