Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXA9P31269 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA9P31269 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms