Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALDH4A1P30038 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALDH4A1P30038 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms