Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ARID4AP29374 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ARID4AP29374 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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