Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRMP28827 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRMP28827 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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