Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRKACBP22694 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms