Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB3BP20337 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms