Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC9A1P19634 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms