Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DESP17661 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DESP17661 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DESP17661 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DESP17661 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DESP17661 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DESP17661 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DESP17661 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DESP17661 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DESP17661 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DESP17661 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DESP17661 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms