Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DOBP13765 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DOBP13765 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms