Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BMP4P12644 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BMP4P12644 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms