Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PGA3P0DJD8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms