Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms