Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HSP90AB1P08238 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB1P08238 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB1P08238 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB1P08238 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB1P08238 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB1P08238 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB1P08238 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB1P08238 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB1P08238 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB1P08238 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB1P08238 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB1P08238 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB1P08238 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB1P08238 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms