Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSD2O96028 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSD2O96028 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSD2O96028 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSD2O96028 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSD2O96028 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSD2O96028 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSD2O96028 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSD2O96028 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSD2O96028 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSD2O96028 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSD2O96028 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NSD2O96028 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NSD2O96028 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NSD2O96028 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NSD2O96028 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NSD2O96028 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NSD2O96028 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NSD2O96028 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSD2O96028 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSD2O96028 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSD2O96028 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NSD2O96028 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NSD2O96028 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSD2O96028 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSD2O96028 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NSD2O96028 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NSD2O96028 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSD2O96028 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NSD2O96028 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSD2O96028 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSD2O96028 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSD2O96028 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSD2O96028 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSD2O96028 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSD2O96028 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSD2O96028 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSD2O96028 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSD2O96028 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSD2O96028 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NSD2O96028 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms