Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PPFIA3O75145 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PPFIA3O75145 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms