Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATG13O75143 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATG13O75143 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATG13O75143 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATG13O75143 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms