Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC3O60481 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms