Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CREB3O43889 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CREB3O43889 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CREB3O43889 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms