Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCAO15360 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCAO15360 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCAO15360 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCAO15360 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCAO15360 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCAO15360 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCAO15360 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCAO15360 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCAO15360 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCAO15360 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCAO15360 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCAO15360 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCAO15360 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCAO15360 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCAO15360 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCAO15360 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCAO15360 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCAO15360 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCAO15360 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCAO15360 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCAO15360 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCAO15360 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCAO15360 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FANCAO15360 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FANCAO15360 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FANCAO15360 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FANCAO15360 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FANCAO15360 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FANCAO15360 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCAO15360 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCAO15360 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCAO15360 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms