Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CEP290O15078 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CEP290O15078 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CEP290O15078 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CEP290O15078 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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