Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRAMEF26H0Y7S4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRAMEF26H0Y7S4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms