Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERVV-2B6SEH9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms