Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ERVV-1B6SEH8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms