Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERINC4A6NH21 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms