Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP16Q9Y5T5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP16Q9Y5T5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms