Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF3C3Q9Y5Q9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms