Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HECTD4Q9Y4D8 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms