Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms