Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YBX2Q9Y2T7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms