Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms