Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PACSIN3Q9UKS6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms