Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
RIMS3Q9UJD0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RIMS3Q9UJD0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms