Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPN3Q9UHW5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms