Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CFDP1Q9UEE9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFDP1Q9UEE9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms