Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLKQ9UBT6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms